工作原理：

　　首先測得待測微生物的蛋白質指紋譜圖（PMF），然后將這些指紋譜圖與儀器中的各種微生物標準指紋圖譜庫進行匹配檢索，從而完成對微生物的鑒定，一臺儀器便可同時檢測細菌和真菌。與常規的形態學分析和分子生物學鑒定方法相比，具有速度快（只需幾分鐘）、操作簡便、成本絕對低廉（降低10倍以上），準確度高（超過95%），并且同時可以進行同源性分析和常規的耐藥性分析，廣泛應用于臨床微生物(包括細菌和真菌)的高通量快速鑒定、疾控中心的微生物傳染病原的鑒定與監測、海關進出口商品的檢驗檢疫、食品生產中的微生物檢測工業、農業和環境中的細菌監測等領域，具有廣闊的市場前景和重要的社會意義。

　　

　　和傳統的微生物鑒定方法相比，質譜技術鑒定微生物的優點是：

　　1、速度快：細菌培養后，1小時內完成數十個樣本的鑒定，可以提前5-48小時出具鑒定結果；

　　2、成本低：質譜技術的鑒定成本是傳統生化方法的一半左右；

　　3、鑒定結果準確，客觀，無需經驗豐富的專業技術人員。

　　

　　微生物質譜鑒定系統主要應用領域：

　　1、臨床微生物的高通量快速鑒定；

　　2、疾控中心的微生物傳染病原的鑒定與監測；

　　3、檢驗檢疫；

　　4、食品生產與微生物檢測；

　　5、工業、農業和環境中的細菌檢測。